一、应遵循的几个原则
一是：选择的品种要适合本地的审美习惯。因不同的地方对花卉的审美有不同的观点，包括花色、花朵大小以及一些特殊的风俗习惯要求等。
二是：选择的品种要和季节相对应。有些品种季节性很强，如羽衣甘蓝、雏菊、金盏菊、三色堇等，适合秋季播种；夏堇、鸡冠花、长春花、千日红等适合春夏季播种；而一串红、四季海棠、万寿菊、百日草、矮牵牛等只要条件适宜，四季均可播种。
三是：要根据自身的生产条件和技术水平来选种。如杂交1代（即F1代）草本花卉育苗条件要求较高，一般需要在保护地育苗。特别是进行反季节栽培时，更要注意温度、湿度和光照条件的控制。四季海棠、矮牵牛等，其种子微小，没有熟练的播种技术和合适的育苗条件，很难达到理想的效果。
二、确定选择时期
在花卉栽培中，应结合不同类型的花卉及栽培上的实际需要，可在以下几个时期进行选择，以弃劣选优。
一是：幼苗期的选择。在移植或定植时，根据植物性状的相关性进行一次选择，保留具有优良典型性状的植株，淘汰那些优良性状不明显或有分离变异的植株。
二是：初花期的选择。草花品种的良种繁育应抓住这一时期除杂去劣，能有效地保持其早花的优良性状。
三是：盛花期的选择。盛花期是确定花朵典型性状的最佳选择期，一般采用混合选择的方法，即按照所栽培花卉的观赏性及经济性状，从一个原始的混杂群体或品种当中，选出具有优质花色或优良性状的植株，种植后次年再与标准品种进行鉴别比较，这样经过一次或多次选择，便能选出后代不再分离的、具有优良性状的植株。
而有些草本花卉，如鸡冠花、金鱼草、瓜叶菊、三色堇、石竹类等，因品种间极易出现天然杂交的现象，引起品种间的混杂、退化。对这类花卉选种时，要特别注意采取品种间的隔离措施，防止串粉，使后代发生变异。对于某些菊花类草花，如波斯菊、瓜叶菊等，其花由舌状花和管状花两部分组成，选择这类花卉的留种单株时应特别注意不引人注目的管状花的颜色，如果单纯依据引人注目的舌状花的颜色留种单株，则往往会造成优良花色逐步退化的情况。
三、选择的部位
从选种的角度看，同一单株不同部位的花序或小花所产生的种子，其保留品种典型性程度也不同。一般规律是在种株上最先开的花，能比晚开的花产生更好的种子后代，如花期早、花朵大、花色艳等。以鸡冠花为例：以中央花序的中下部产生的种子为佳。金鱼草总状花序中下部的种子结实率高。还有百日草、千日红、半枝莲、紫茉莉等也是如此。
对于某些花朵着生于主枝和侧枝上的花卉品种，如波斯菊、矮牵牛、金鱼草等，每个果实中的种子重量一般由下而上递减，发芽率也由下而上递减，它们所产生的后代在长势上也有显著的差异，因此，这样就要选择下部花朵所产生的种子。即使同一花序不同位置的种子，其后代保留品种典型性的程度也不同。如翠菊、万寿菊、矢车菊等菊类花卉，着生在花盘边缘的种子，最能保持其优良性状。花盘中心所结的种子籽粒不壮，优良性状不理想，最好不宜留种使用。